기능-의약 단백질체 연구 실험실에서는 질량분석기를 이용한 "Shotgun Protemics" 방법으로 단백질체 분석 연구를 하고 있습니다. Shotgun proteomics approach를 통해 좀 더 높은 분석 감도 및 분석의 효율성을 확보할 수 있으며, 장기적 관점에서 분석의 자동화에도 이점을 가지고 있습니다. Shotgun proteomics는 질량분석기를 통한 tandem mass spectrometric 데이터를 기반으로 Protein database를 참조하여 단백질을 동정합니다.

Shotgun proteomics approach는 특정 시료의 whole proteome 분석외에도, Phosphorylation를 포함한 proteome의 Post translational modification 분석, 특정 단백질의 absolute/relative quantification이 가능하며, cancer를 포함한 다양한 연구분야에서 Protein의 변화를 확인할 수 있는 분석 방법으로 사용되고 있습니다. 나아가, Academic study 외에도, Enzyme-linked immunosorbent assay(ELISA)와 같이 임상적인 질병 진단 분야에서도 경쟁하고 있습니다.