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RNA Genomics and Epigenetics Laboratory

Research

Research

연구 개요

본 연구실에서는 RNA splicing이 어떻게 암 전이 및 유전성 질환을 조절하는지, m6A 를 포함한 mRNA modification이 어떻게 RNA splicing을 조절하는지에 초점을 맞춰 연구 중에 있음

분석 기법 1.

Genome wide RNA-sequencing 생물정보학적 기법으로 Human RNA library 분석

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분석 기법 2.

Human Genome wide shRNA screen: 60,000여개 shRNA를 cell 내 도입하여 기능성 유전자 발굴 및 동정

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분석 기법 3.

분자생물학, 세포생물학, 생화학 등 다양한 기술을 응용하여 세포 내 분자생물학적 기전 규명

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연구 과제 1.

암 전이 특이적 RNA splicing 제어 기전 연구

  • 암 전이 특이적 RNA alternative splicing을 발굴
  • 암 전이 특이적 RNA alternative splicing을 제어하는 신규 유전자 발굴 및 동정
  • 암 전이 특이적 RNA alternative splicing 제어 기전 및 기능 규명
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연구 과제 2.

RNA splicing 제어 기전을 통한 척수성 근위축증 (Spinal Muscular Atrophy) 치료방법 제시

  • shRNA screen으로 척수성 근위축증 내 핵심적 역할을 하는 RNA splicing 제어 기능 유전자 발굴
  • 척수성 근위축증 관련 유전자, SMN의 RNA splicing을 제어 기전 규명
  • 척수성 근위축증 환자 세포 특이적 SMN RNA splicing 검증
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연구 과제 3.

mRNA modification에 의한 RNA splicing 제어 기전과 기능 연구

  • RNA-sequencing, bioinformatics 분석을 통해 m6A에 의해 변화된 RNA splicing 발굴
  • m6A sequencing을 통해 m6A 위치 규명 및 지도 제작
  • m6A에 의해 변화되는 RNA splicing 제어 기전 규명 및 유전자 발현에 대한 새로운 고찰
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